校医院中心校区设有全科、急诊、内、外、妇、中医、口腔、五官、理疗、药房、预防保健、计划免疫等临床科室,设有检验、放射、B超、心电图等辅助科室。
校医院软件园门诊部设有全科门诊、治疗室、观察室和药房等。
校医院千佛山校区设有全科、内、外、妇、口腔、理疗、预防保健、计划免疫等临床科室,设有检验、放射、B超、心电图、挂号、药房等辅助科室。
校医院兴隆山门诊部设有全科诊室、治疗室、观察室、挂号室、药房、检验、放射、理疗、心电图、预防接种等科室。
校医院趵突泉校区设有内、外、妇、中医、理疗等临床科室,设有检验、放射、B超、心电图等辅助科室。